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Western blot 實(shí)驗(yàn)技巧精要

Western blot 實(shí)驗(yàn)技巧精要
——輕松獲得高質(zhì)量 western blot 條帶圖
 
Western blot 方法在 SCI 文章中出現(xiàn)的頻率非常高,漂亮的 WB 電泳圖可以給文章增色不少。但是 WB 實(shí)驗(yàn)的步驟瑣碎,細(xì)節(jié)頗多,要想得到令人滿意的結(jié)果還是需要花費(fèi)很多時(shí)間和精力去摸索實(shí)驗(yàn)技巧的。
 
小編經(jīng)過了一段時(shí)間的努力,已經(jīng)可以比較輕松的實(shí)現(xiàn)用 WB 方法對(duì)磷酸化蛋白計(jì)算藥物的 IC50 值(見下圖)。
    
 
接下來,小編將結(jié)合自己的經(jīng)驗(yàn)以及網(wǎng)上可以搜索到的 WB 實(shí)驗(yàn)技巧,為大家介紹一下 WB 實(shí)驗(yàn)過程中的關(guān)鍵點(diǎn)。雖然 WB 實(shí)驗(yàn)步驟很多,但只要抓中其中的幾個(gè)重點(diǎn)方面,就可以得到干凈、漂亮、清晰、客觀的電泳圖。
 
一、 樣品準(zhǔn)備部分
小編認(rèn)為,我們不應(yīng)該太過重視 WB 電泳部分的操作技巧,樣品準(zhǔn)備才是整個(gè) WB 實(shí)驗(yàn)中**重要的一個(gè)環(huán)節(jié)(沒有之一)。否則 WB 電泳技術(shù)再高也無法得到好的結(jié)果。小編認(rèn)為以下 3 點(diǎn)值得大家重點(diǎn)關(guān)注:
 
1. 注意孵育、終止時(shí)間
如果想得到漂亮的梯度條帶,無論是不同處理時(shí)間的樣品,還是不同給藥濃度的樣品,在處理過程中都一定要嚴(yán)格按照設(shè)計(jì)的時(shí)間來孵育和終止,尤其是對(duì)于磷酸化蛋白,哪怕 1 秒也不要提前或耽擱。
 
2. 抑制蛋白降解
這是樣品制備中**需要注意的部分。抑制樣品蛋白降解的方法主要有兩種:
 
(1) 使用蛋白酶抑制劑
小編使用的是羅氏公司(Roche)的蛋白酶抑制劑 Cocktail 片劑,效果不錯(cuò)。再與 PMSF 共同使用,可以很好地抑制蛋白降解。
 
(2) 全程低溫操作
提前預(yù)冷 PBS、裂解液甚**槍頭等,從收集細(xì)胞開始一直到煮樣的全過程都應(yīng)該盡可能的保持在冰上操作。小編除了使用冰盒,大多數(shù)操作都是在 4℃冷房中進(jìn)行的,雖然有點(diǎn)麻煩和辛苦,但是效果非常好。
 
3. 裂解液用量
將收集好的細(xì)胞加入裂解液進(jìn)行裂解在操作上是非常簡(jiǎn)單的,所以這一步的重要性很容易被大家忽視。裂解液的用量直接決定了細(xì)胞裂解程度以及裂解后的蛋白濃度。
 
如果加入的裂解液不足,蛋白濃度太高,會(huì)造成與上樣緩沖液反應(yīng)不充分,電泳后會(huì)出現(xiàn)多條條帶,條帶形狀也不好。小編做磷酸化蛋白檢測(cè)時(shí)為了在每個(gè)膠孔中盡可能多上樣,所以用體積較少的裂解液制備了濃度很高的蛋白,結(jié)果就得不償失了(見下圖)。

 
這種情況的補(bǔ)救方法是給樣品繼續(xù)補(bǔ)加上樣緩沖液,煮樣,再跑膠。直接給已經(jīng)煮過樣的樣品補(bǔ)加上樣緩沖液再煮樣,跑膠后的效果也會(huì)好很多(見下圖)。
 
如果加入的裂解液過多,蛋白濃度太低,會(huì)導(dǎo)致在膠孔中的上樣量不足,條帶不清晰。
那么加入多少體積的裂解液**好呢?小編認(rèn)為,加入細(xì)胞團(tuán)體積的 10 倍體積的裂解液是一個(gè)比較好配比,當(dāng)然也可以根據(jù)目標(biāo)蛋白進(jìn)行調(diào)整。
 
二、 WB 電泳部分
得到了高質(zhì)量的樣品就已經(jīng)很接近成功了,小編接下來為大家介紹一些 WB電泳部分的注意事項(xiàng)。
 
1. 制膠
小編建議大家直接用制膠試劑盒,價(jià)格不貴,質(zhì)量不錯(cuò)。如果自己配置母液,就請(qǐng)注意 pH 值。
 
制膠部分**重要的是在配濃縮膠前不要著急將分離膠上面的水棄掉,先配好濃縮膠,在加 TEMED 之前再棄掉水。小編雖然沒有親自試過,但是如果棄掉水后 5 分鐘之內(nèi)還沒有加上濃縮膠,這塊膠**好還是不要用了。
 
2. 上樣
小編的經(jīng)驗(yàn)是上樣的總蛋白量一般是 20-70ug,這個(gè)要根據(jù)檢測(cè)蛋白的含量而定,需要摸索。
 
計(jì)算后每個(gè)樣品的上樣體積如果比較小,用槍頭直接上樣是完全可以的,如果上樣量超過 20ul,**好還是用微量注射器來上樣。上樣確實(shí)是需要多多練習(xí)和體會(huì)的,上樣技術(shù)高可以多上 10ul 樣品而不溢出。
 
如果需要上樣的體積太大,也可以先上一部分,然后跑幾分鐘電泳,再停下來繼續(xù)上樣,這是完全可以的,經(jīng)過下一步的調(diào)整,是不會(huì)影響效果的。
 
3. 電泳
每個(gè)孔的上樣量參差不齊沒關(guān)系,在樣品還沒有達(dá)到分離膠時(shí)用≤60V 的電壓可以很好的將樣品排列整齊,不容易跑出弧線或者不齊的線。
 
當(dāng)樣品達(dá)到分離膠后,通常會(huì)改成 100V 繼續(xù)電泳,小編認(rèn)為如果時(shí)間充足,電壓低一點(diǎn)效果不錯(cuò)。
 
請(qǐng)注意:電壓改一次就好,不要多次調(diào)整。
 
4. 轉(zhuǎn)膜
在轉(zhuǎn)膜環(huán)節(jié)小編認(rèn)為**重要的,也是**容易被大家忽視的一步是:預(yù)冷電轉(zhuǎn)液。大家一定感覺到過,電轉(zhuǎn)液加入甲醇后溫度會(huì)迅速上升,所以建議跑上電泳就配電轉(zhuǎn)液,加入甲醇后放入 4℃冰箱預(yù)冷。#p#分頁標(biāo)題#e#
 
當(dāng)然,也不要忘了趕氣泡,趕氣泡時(shí)方向不要太隨意,也不要太用力,否則可能會(huì)使膠變形,尤其是邊緣部分,然后你的條帶就會(huì)……比較有藝術(shù)感了……(見下圖)
 
**后別忘了膜需要先在甲醇中浸泡一下,然后在電轉(zhuǎn)液中洗一洗再使用。
 
5. 封閉、一抗、二抗
很多 WB 技巧介紹都會(huì)根據(jù)曝光后的電泳圖的效果指出需要降低或提高一抗的稀釋倍數(shù),延長或減少二抗孵育時(shí)間等等。小編認(rèn)為只要按照說明書上推薦的比例做就沒有問題。出現(xiàn)各種條帶不好的情況,更大的可能是前面步驟中出現(xiàn)了問題,而不是這一步。
 
如果是用雜交袋進(jìn)行一抗和二抗的孵育,小編建議大家在放入膜后,將雜交袋中的 TBS-T 趕出來,然后再加入一抗或二抗,這樣一抗和二抗就不會(huì)被膜上殘留的 TBS-T 稀釋了。
 
6. 曝光
當(dāng)電泳圖上的條帶不夠好時(shí),曝光相關(guān)參數(shù)也是經(jīng)常被認(rèn)為是需要調(diào)整的部分。小編依然認(rèn)為,曝光不是關(guān)鍵的步驟,前面做好了,曝光是很簡(jiǎn)單的。小編用的是 ECL 發(fā)光液曝光法。這種方法**需要注意的就是 ECL 要在條帶上分布均勻。小編用的是普通自封袋,將膜放在一片自封袋上,加上發(fā)光液后,再蓋上一片自封袋,用手指趕一下,發(fā)光液就會(huì)比較均勻,效果不錯(cuò)。
 
以上就是小編認(rèn)為 WB 實(shí)驗(yàn)中**需要注意的部分,相信做好以上內(nèi)容,做WB 實(shí)驗(yàn)會(huì)成為一項(xiàng)樂趣。小編想再次提醒一下大家,樣品制備部分是非常重要的,拼技術(shù)和經(jīng)驗(yàn)主要在這一部分。相比之下,WB 電泳部分雖然也有一定的技巧,但更多的是拼態(tài)度。小編很喜歡 WB 實(shí)驗(yàn),希望這些技巧能夠幫助您愛上western blot 實(shí)驗(yàn)!