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SDS-PAGE電泳測定蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量概述

實驗原理 
    SDS-PAGE電泳法,即十二烷基硫酸鈉—聚丙烯酰胺凝膠電泳法,。 
?1.在蛋白質(zhì)混合樣品中各蛋白質(zhì)組分的遷移率主要取決于分子大小和形狀以及所帶電荷多少。 
?2.在聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中,加入一定量的十二烷基硫酸鈉(SDS),SDS是一種陰離子表面活性劑,加入到電泳系統(tǒng)中能使蛋白質(zhì)的氫鍵和疏水鍵打開,并結(jié)合到蛋白質(zhì)分子上(在一定條件下,大多數(shù)蛋白質(zhì)與SDS的結(jié)合比為1.4gSDS/1g蛋白質(zhì)),使各種蛋白質(zhì)—SDS復合物都帶上相同密度的負電荷,其數(shù)量遠遠超過了蛋白質(zhì)分子原有的電荷量,從而掩蓋了不同種類蛋白質(zhì)間原有的電荷差別。此時,蛋白質(zhì)分子的電泳遷移率主要取決于它的分子量大小,而其它因素對電泳遷移率的影響幾乎可以忽略不計。  
?3. 當?shù)鞍踪|(zhì)的分子量在15000~200000之間時,電泳遷移率與分子量的對數(shù)值呈直線關(guān)系,符合下列方程:  
                     1gMr =K―bmR 
            式中:Mr為蛋白質(zhì)的分子量;K為常數(shù);b為斜率;mR為相對遷移率。在條件一定時,b和K均為常數(shù)。 
            若將已知分子量的標準蛋白質(zhì)的遷移率對分子量的對數(shù)作圖,可獲得一條標準曲線。未知蛋白質(zhì)在相同條件下進行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標準曲線上求得分子量。

儀器、原料和試劑 
?儀器:垂直板型電泳槽;直流穩(wěn)壓電源;50或100μl微量注射器、玻璃板、水浴鍋,染色槽;燒杯;吸量管;常頭滴管等。 
?原料:低分子量標準蛋白質(zhì)按照每種蛋白0.5~1mg·ml-1樣品溶解液配制??膳渲瞥蓡我坏鞍踪|(zhì)標準液,也可配成混合蛋白質(zhì)標準液。 ?試劑: 
   (1)分離膠緩沖液(Tris-HCl緩沖液 PH8.9):取1mol/L鹽酸48mL,Tris 36.3g,用無離子水溶解后定容**100mL。 
   (2)濃縮膠緩沖液(Tris-HCl緩沖液 PH6.7):取1mol/L鹽酸48mL, Tris 5.98g,用無離子水溶解后定容**100mL。 
   (3)30%分離膠貯液:配制方法與連續(xù)體系相同,稱丙烯酰胺(Acr) 30g及N,N’-甲叉雙丙烯酰胺(Bis)0.8g,溶于重蒸水中,**后定容**100ml,過濾后置棕色試劑瓶中,4℃保存。    (4)10%濃縮膠貯液:稱Acr 10g及Bis 0.5g,溶于重蒸水中,**后定容**100mL,過濾后置棕色試劑瓶中,4℃貯存。 
   (5)10%SDS溶液:SDS在低溫易析出結(jié)晶,用前微熱,使其完全溶解。    (6)1%TEMED; 
    (7)10%過硫酸銨(AP):現(xiàn)用現(xiàn)配。 
   (8)電泳緩沖液(Tris-甘氨酸緩沖液PH8.3):稱取Tris 6.0g, 甘氨酸28.8g, SDS 1.0g, 用無離子水溶解后定容**1L。 
   (9)樣品溶解液:取SDS 100mg,巰基乙醇0.1mL,甘油1mL,溴酚藍2mg,0.2mol/L,pH7.2磷酸緩沖液0.5mL,加重蒸水**10mL(遇液體樣品濃度增加一倍配制)。用來溶解標準蛋白質(zhì)及待測固體。 
   (10)染色液:0.25g考馬斯亮藍G-250,加入454mL 50%甲醇溶液和46mL冰乙酸即可。    (11)脫色液:75mL冰乙酸,875mL重蒸水與50mL甲醇混勻。 實驗步驟 
?1. 安裝夾心式垂直板電泳槽:目前,夾心式垂直板電泳槽有很多型號,雖然設(shè)置略有不同,但主要結(jié)構(gòu)相同,且操作簡單,不易泄漏。同學們可根據(jù)具體不同型號要求進行操作。主要注意:安裝前,膠條、玻板、槽子都要潔凈干燥;勿用手接觸灌膠面的玻璃。 
?2.配膠:根據(jù)所測蛋白質(zhì)分子量范圍,選擇適宜的分離膠濃度。本實驗采用SDS-PAGE不連續(xù)系統(tǒng),按下表的配制分離膠和濃縮膠。 ?
重蒸餾水  
11.87 10.20 8.54 5.20 4.60 
混勻后,置真空干燥器中,抽氣10min 10%AP 0.10 0.10 0.10 0.10 0.05 
 
?3.制備凝膠板: 
   (1)分離膠制備:按表配制20ml 10%分離膠,混勻后用細長頭滴管將凝膠液加**長、短玻璃板間的縫隙內(nèi),約8cm高,用1ml注射器取少許蒸餾水,沿長玻璃板板壁緩慢注入,約3—4mm高,以進行水封。約30min后,凝膠與水封層間出現(xiàn)折射率不同的界線,則表示凝膠完全聚合。傾去水封層的蒸餾水,再用濾紙條吸去多余水分。 
   (2)濃縮膠的制備:按表配制10ml 3%濃縮膠,混勻后用細長頭滴管將濃縮膠加到已聚合的分離膠上方,直**距離短玻璃板上緣約0.5cm處,輕輕將樣品槽模板插入濃縮膠內(nèi),避免帶入氣泡。約30min后凝膠聚合,再放置20—30min。待凝膠凝固,小心拔去樣品槽模板,用窄條濾紙吸去樣品凹槽中多余的水分,將pH8.3 Tris-甘氨酸緩沖液倒入上、下貯槽中,應(yīng)沒過短板約0.5cm以上,即可準備加樣。   
?4.樣品處理及加樣 
    各標準蛋白及待測蛋白都用樣品溶解液溶解,使?jié)舛葹?.5~1mg/mL,沸水浴加熱3分鐘,冷卻**室溫備用。處理好的樣品液如經(jīng)長期存放,使用前應(yīng)在沸水浴中加熱1分鐘,以消除亞穩(wěn)態(tài)聚合。 #p#分頁標題#e#
    一般加樣體積為10-15μL(即2-10μg蛋白質(zhì))。如樣品較稀,可增加加樣體積。用微量注射器小心將樣品通過緩沖液加到凝膠凹形樣品槽底部,待所有凹形樣品槽內(nèi)都加了樣品,即可開始電泳。   
?5.電泳 
    將直流穩(wěn)壓電泳儀開關(guān)打開,開始時將電流調(diào)**10mA。待樣品進入分離較時,將電流調(diào)**20-30 mA。當藍色染料遷移**底部時,將電流調(diào)回到零,關(guān)閉電源。拔掉固定板,取出玻璃板,用刀片輕輕將一塊玻璃撬開移去,在膠板一端切除一角作為標記,將膠板移**大培養(yǎng)皿中染色。 
?6.染色及脫色 
    將染色液倒入培養(yǎng)皿中,染色1h左右,用蒸餾水漂洗數(shù)次,再用脫色液脫色,直到蛋白區(qū)帶清晰,即用直尺分別量取各條帶與凝膠頂端的距離。 計算 
?1.相對遷移率mR =樣品遷移距離(cm)/染料遷移距離(cm) 
?2.以標準蛋白質(zhì)分子量的對數(shù)對相對遷移率作圖,得到標準曲線,根據(jù)待測樣品相對遷移率,從標準曲線上查出其分子量。 注意事項  
?1.   不是所有的蛋白質(zhì)都能用SDS-凝膠電泳法測定其分子量,已發(fā)現(xiàn)有些蛋白質(zhì)用這種方法測出的分子量是不可靠的。包括:電荷異?;驑?gòu)象異常的蛋白質(zhì),帶有較大輔基的蛋白質(zhì)(如某些糖蛋白)以及一些結(jié)構(gòu)蛋白如膠原蛋白等。例如組蛋白F1,它本身帶有大量正電荷,因此,盡管結(jié)合了正常比例的SDS,仍不能完全掩蓋其原有正電荷的影響,它的分子量是21,000,但SDS-凝膠電泳測定的結(jié)果卻是35,000。因此,**好**少用兩種方法來測定未知樣品的分子量,互相驗證。  
?2.有許多蛋白質(zhì),是由亞基(如血紅蛋白)或兩條以上肽鏈(如α-胰凝乳蛋白酶)組成的,它們在SDS和巰基乙醇的作用下,解離成亞基或單條肽鏈。因此,對于這一類蛋白質(zhì),SDS-凝膠電泳測定的只是它們的亞基或單條肽鏈的分子量,而不是完整分子的分子量。為了得到更全面的資料,還必須用其它方法測定其分子量及分子中肽鏈的數(shù)目等,與SDS-凝膠電泳的結(jié)果互相參照。