核酸印跡是一種成熟的技術(shù)，用于鑒定先前在凝膠中分離的特定核苷酸序列的存在。（

Southern印跡以其發(fā)明者英國生物學(xué)家Edwin Southern命名。在Southern印跡中，分析DNA，在Northern印跡中如果是RNA。在這兩種情況下，來自完整凝膠的DNA或RNA都將轉(zhuǎn)移到一塊硝酸纖維素膜或尼龍膜上。然后將膜暴露于雜交探針，即具有特定序列的單個(gè)DNA片段，要確定其在靶DNA（或RNA）中的存在。對探針DNA進(jìn)行標(biāo)記，以便可以通過射線照相，熒光或化學(xué)發(fā)光法對其進(jìn)行檢測。

印跡的第一步是核酸從凝膠到膜的轉(zhuǎn)移，這通常使用毛細(xì)管轉(zhuǎn)移方法完成。在此過程中，將凝膠放置在紙芯的頂部，該紙芯浸入包含轉(zhuǎn)移緩沖液的容器中。膜夾在凝膠和一堆吸收性材料（通常是干紙巾）之間，該吸收性材料通過毛細(xì)管作用使轉(zhuǎn)移緩沖液通過凝膠。然后，凝膠中的核酸分子被緩沖液攜帶并固定在膜上。真空吸印是另一種越來越流行的吸印程序，因?yàn)樗俣雀烨一厥章屎芨?。真空印跡法還使用緩沖液流將核酸帶轉(zhuǎn)移到膜上，但是它使用真空而不是毛細(xì)管作用來創(chuàng)建該流。

一旦轉(zhuǎn)移完成，最初在凝膠上的所有核酸帶就被固定（印跡）在膜上，雜交過程可能開始。將膜與一小段DNA或RNA（探針）一起孵育，該DNA或RNA的序列與膜中特定的DNA或RNA序列互補(bǔ)。這允許探針與膜上的特定DNA片段雜交或結(jié)合。探針先前已被標(biāo)記，通常用放射性原子，熒光染料標(biāo)記或用酶標(biāo)記，該酶在與合適的底物孵育后會(huì)產(chǎn)生化學(xué)發(fā)光信號(hào)。雜交后，標(biāo)記的探針允許從膜上許多不同的DNA片段中檢測目標(biāo)DNA片段。